Гимназия осуществляет образовательный процесс в соответствии с уровнями общего образования:
Начальное общее образование: 1 — 4 классы;
Основное общее образование: 5 — 9 классы;
Среднее общее образование: 10 — 11 классы.
Профильное обучение в 10-11 классах осуществляется на основе социального заказа родителей и учащихся. В основу обучения 10-11 классов положена дифференциация учебного процесса в соответствии с профильными направлениями обучения.
Реализация адаптированных программ осуществляется на уровне начального общего образования и основного общего образования по индивидуальным учебным планам.
В МОУ «Гимназия «Авиатор» образование (обучение) осуществляется на русском языке.
В гимназии преподаются: в качестве государственного языка — русский язык, в качестве иностранного — английский и французский языки.